Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP16Q9Y5T5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP16Q9Y5T5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms