Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms