Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WASHC2CQ9Y4E1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms