Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms