Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms