Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MBD2Q9UBB5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD2Q9UBB5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms