Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP5Q9NZZ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms