Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GDE1Q9NZC3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GDE1Q9NZC3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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