Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN6Q9NWW5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms