Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCLQ9NW38 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms