Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms