Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms