Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRIMPOLQ96LW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRIMPOLQ96LW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms