Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms