Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms