Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms