Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
COPS9Q8WXC6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms