Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DNAJA4Q8WW22 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms