Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms