Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms