Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms