Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC63Q8NA47 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms