Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AGAP6Q5VW22 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms