Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms