Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AKAP4Q5JQC9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKAP4Q5JQC9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms