Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVEP1Q4LDE5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms