Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MICAQ29983 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms