Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PTPRNQ16849 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRNQ16849 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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