Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1EQ15878 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms