Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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