Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC23BQ15437 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SEC23BQ15437 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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