Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms