Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IHHQ14623 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IHHQ14623 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IHHQ14623 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IHHQ14623 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IHHQ14623 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IHHQ14623 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms