Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBFBQ13951 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms