Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDX39BQ13838 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms