Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BNIP3Q12983 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms