Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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KCNMA1Q12791 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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KCNMA1Q12791 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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