Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD300CQ08708 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms