Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LTBQ06643 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms