Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OC90Q02509 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OC90Q02509 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms