Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP27A1Q02318 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP27A1Q02318 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP27A1Q02318 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP27A1Q02318 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP27A1Q02318 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms