Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF9Q00978 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms