Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX6P78412 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX6P78412 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms