Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VBP1P61758 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VBP1P61758 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms