Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms