Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms