Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD34P28906 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD34P28906 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD34P28906 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD34P28906 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms