Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms