Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms