Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZKSCAN1P17029 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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